Alimentary Pharmacology and Therapeutics dergisinde yayınlanan yeni bir çalışma, hepatit B virüsü (HBV) haplotip sayısı ikiden az veya ikiye eşit olan hastaların kronik hepatit B tedavisi ile fonksiyonel bir kür elde etme olasılığının daha yüksek olduğunu bildirmektedir.
Kronik hepatit B (KHB), HBV enfeksiyonunun neden olduğu potansiyel olarak ölümcül bir karaciğer hastalığıdır. Dünya çapında tahmini 296 milyon kişiyi etkileyen KHB enfeksiyonu, siroz ve karaciğer kanserine bağlı ölüm riskinin artmasıyla ilişkilidir. 2015 yılında tahminen 887.000 kişi doğrudan KHB ile ilişkili hastalıklardan ölmüştür. KHB’nin bilinen bir tedavisi yoktur; ancak nadir durumlarda, bazı antiviraller ‘fonksiyonel tedavi‘ olarak bilinen şeyi veya hepatit B yüzey antijeninin (HBsAg) kandan uzaklaştırılmasını sağlayabilir.
HBV, viral replikasyon için gerekli olan ribonükleik asit (RNA) fazına sahip bir deoksiribonükleik (DNA) virüstür. RNA DNA’ya kopyalandığında redaksiyon yoktur, bu da HBV genomunun dokuz varyant A-I genotipinin ortaya çıkmasına neden olmuştur.
HBV’nin A ve D genotipleri Batı ülkelerinde daha yaygınken, B ve C genotipleri Asya’da, E genotipi ise Afrika’da sıklıkla tespit edilmektedir. Haplotip sayısı (HN) esasen bu çeşitliliğin bir ölçüsüdür ve daha düşük bir değer, daha az çeşitli bir viral genomu gösterir.
HBeAg-pozitif bir test kohortu ve bağımsız HBeAg-pozitif doğrulama kohortu kullanan bu çalışmadaki araştırmacılar, başlangıçta hasta başına düşen HN’nin (Haplotip sayısı) antiviral tedavi alan hastalarda fonksiyonel iyileşmeyi veya fonksiyonel tedaviye ulaşamama durumunu öngörmek için uygun bir biyobelirteç olup olmadığını ve bunun genotipe özgü olup olmadığını araştırmıştır.
Tenofovir disoproksil fumarat (TDF) tedavisi sırasında HN’nin HBsAg kaybının bir biyobelirteci olarak kullanılıp kullanılamayacağını belirlemek için 86 HBV genotip A ve D hastasından alınan HBeAg-pozitif başlangıç örnekleri incelenmiştir. Bulgular, TDF veya tenofovir alafenamid tedavisi kullanan HBV genotipleri A ve D olan 181 hastadan alınan başlangıç numuneleri kullanılarak doğrulanmıştır.
Başlangıç örneklerinde, haplotipleri yeniden yapılandırmak için kısa okumalı NGS verileri için özel olarak oluşturulmuş, yakın zamanda geliştirilmiş bir haplotip, yeniden yapılandırma programı olan CliqueSNV sürümü kullanılmıştır. Her kohorttaki HBsAg-pozitif ve HBsAg-kayıp hastalar, HBsAg-pozitif hastaları HBsAg-kayıp hastalardan ayırmak için en uygun eşiği belirlemek üzere birleştirilmiştir.
HBeAg-pozitif hastalarda tedavi öncesi HN, HBeAg-negatif hastalara kıyasla daha düşüktür. HBeAg-pozitif G103 test kohortunda, HN A ve D genotipleri için B ve C genotiplerine kıyasla önemli ölçüde daha düşüktü.
Bu bulgular, sekans değişkenliğinin veya ‘plastisitenin‘ HBsAg kaybı olasılığının azalmasıyla ilişkili olduğunu göstermektedir. Buna ek olarak, HN seviyeleri Asya genotipleri B ve C’de genotip A ve D’ye göre daha yüksektir; bunun nedeni muhtemelen genotip B ve C’nin genellikle doğum sırasında veya doğumdan kısa bir süre sonra edinilmiş olması, genotip A ve D’nin ise genellikle yaşamın ilerleyen dönemlerinde edinilmiş olmasıdır.
G103 test kohortunda HBeAg pozitif kalan hastalarla karşılaştırıldığında, tedavi sırasında HBeAg kaybeden hastalar arasında başlangıçtaki HN değerleri açısından bir fark bulunmamıştır. Bununla birlikte, tedavi sırasında HBsAg kaybı olan genotip A veya D hastalarının başlangıçta daha düşük genom uzunluğunda HBV HN’si vardı.
Basit lojistik regresyon (SLR) modellemesine göre, başlangıçtaki HN biyobelirteci en güçlü belirleyici olurken, çok değişkenli lojistik regresyon (MLR) analizi, bu biyobelirtecin diğer klinik değişkenlerden etkilenmediğini göstermiştir. Dolayısıyla, ikili HN biyobelirteçleri, fonksiyonel iyileşme (HBsAg kaybı) elde edecek veya tedavi sırasında HBsAg için pozitif kalacak hastaları belirlemek için bağımsız temel biyobelirteçlerdir.
HN metodolojisi, mevcut antiviral tedavilerle, fonksiyonel kür elde etme olasılığı düşük olan ve yeni tedaviler geliştirildikçe ek bir tedaviye ihtiyaç duyabilecek hastaları belirleyerek klinik faydaya sahiptir. Ayrıca bu yaklaşım, başlangıçta daha düşük HN ile başvuran hangi hastaların fonksiyonel iyileşme veya HBsAg kaybı elde etme olasılığının daha yüksek olduğunu belirleyebilir. HN aynı zamanda başlangıçtaki HBsAg veya HBV DNA seviyelerinden daha iyi bir biyobelirteçtir.
Doherty Enstitüsü’nde VIDRL Kıdemli Tıp Bilimcisi olarak görev yapan Royal Melbourne Hastanesi’nden Dr. Margaret Littlejohn, bunun klinisyenlere hastalarını daha verimli bir şekilde tedavi edebilmeleri için araçlar sağlama konusunda büyük bir adım olduğunu söyledi. Genom uzunluğu NGS verileri ve haplotip rekonstrüksiyonu, HBV genotip A ve D hastalarında mevcut antiviral tedavi rejimlerinde klinik olarak istenen sonuçlar için yeni bir belirteç sağlar.